Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mvb12bQ6KAU4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms