Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sohlh1Q6IUP1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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