Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt40Q6IFX3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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