Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scaf8Q6DID3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scaf8Q6DID3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms