Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtmQ62388 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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