Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Klf3Q60980 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms