Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm1Q60636 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms