Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp13a3Q5XF89 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms