Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms