Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms