Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85aQ5SP85 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms