Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim58Q5NCC9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim58Q5NCC9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms