Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trp53i11Q4QQM4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trp53i11Q4QQM4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms