Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Khdc1cQ4KL78 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Khdc1cQ4KL78 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms