Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

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Length 702 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Zfp235Q499D5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Zfp235Q499D5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Zfp235Q499D5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Zfp235Q499D5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Zfp235Q499D5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp235Q499D5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms