Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ccdc185Q3V118 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc185Q3V118 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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