Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BC051142Q3V0M8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC051142Q3V0M8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms