Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rbm44Q3V089 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rbm44Q3V089 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rbm44Q3V089 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbm44Q3V089 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbm44Q3V089 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbm44Q3V089 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm44Q3V089 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rbm44Q3V089 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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