Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Prdm6Q3UZD5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prdm6Q3UZD5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms