Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec31aQ3UPL0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms