Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nlrc4Q3UP24 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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