Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem253Q3UNB8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Tmem253Q3UNB8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Tmem253Q3UNB8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Tmem253Q3UNB8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem253Q3UNB8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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