Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Parp3Q3ULW8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Parp3Q3ULW8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms