Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc33Q3ULW6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms