Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc34Q3UI66 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc34Q3UI66 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms