Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Nkx6-3Q3UHX8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nkx6-3Q3UHX8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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