Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Q3U6N9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Q3U6N9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Q3U6N9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U6N9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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