Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ssbp4Q3U4B1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssbp4Q3U4B1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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