Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc174Q3U155 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms