Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Palb2Q3U0P1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Palb2Q3U0P1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms