Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd4Q3TT99 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms