Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtf3c3Q3TMP1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms