Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca4Q3TKT4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms