Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc13Q3TIR1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc13Q3TIR1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms