Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem248Q3TBN1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms