Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vax1Q2NKI2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms