Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim71Q1PSW8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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