Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ptchd1Q14B62 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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