Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Perm1Q149B8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms