Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc162pQ0VG85 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms