Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp2b3Q0VF55 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp2b3Q0VF55 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms