Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rundc1Q0VDN7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rundc1Q0VDN7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms