Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrriq1Q0P5X1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms