Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata18Q0P557 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms