Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf541Q0GGX2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms