Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnma1Q08460 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnma1Q08460 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms