Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MestQ07646 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MestQ07646 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MestQ07646 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
MestQ07646 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
MestQ07646 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MestQ07646 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MestQ07646 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms