Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Col9a2Q07643 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms