Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh3bp2Q06649 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp2Q06649 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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