Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrx2Q06348 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms